Recherche sur l'encéphalomyélite myalgique / le syndrome de fatigue chronique (EM / SFC), le syndrome post-traitement de la maladie de Lyme (PTLDS), la fibromyalgie et le syndrome post-COVID .

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Protocole de recherche personnalisé condensé

BUT DE L’ETUDE

Établir un protocole de recherche personnalisé condensé qui peut être utilisé pour caractériser l'EM/SFC chez des patients individuels en ce qui concerne tous les aspects biologiques uniques de leur organisme, en interaction avec une maladie chronique complexe.

CHERCHEURS PRINCIPAUX
  • Christopher Armstrong, PhD
  • Paul Gooley, PhD
  • Neil McGregor, PhD
  • Kathy Huang
MISES À JOUR ET PERSPECTIVES
  • Nous avons collecté des données longitudinales.
  • Le développement de techniques d’apprentissage automatique est en cours.

HYPOTHÈSE ET DESCRIPTION DE L’ÉTUDE

Un protocole de recherche personnalisé condensé consiste en un nombre minimal d’échantillons provenant d’affections spécifiques permettant de développer avec précision une signature biologique propre à une personne atteinte d’EM/SFC et pouvant être utilisée pour prédire l’amélioration ou l’aggravation de ses symptômes.

Ce protocole serait utile pour suivre le développement de l’EM/SFC, fournir une compréhension de la biologie du processus pathologique chez l’individu, stratifier les individus atteints d’EM/SFC en sous-ensembles biologiquement définis, tester l’efficacité des traitements et suivre les résultats des essais de traitements cliniques.

OBJECTIFS

  1. Établir un protocole de recherche personnalisé condensé pouvant être utilisé pour caractériser l’EM/SFC chez les patients en ce qui concerne les aspects biologiques de leur personne et une maladie chronique complexe.
  2. Intégrer et analyser les données des études longitudinales métaboliques.
  3. Échantillonner au hasard les données longitudinales de chaque participant et analyser si un modèle similaire peut être observé avec moins de points de données.
  4. Développer un algorithme pour reconnaître les signatures individuelles et les comparer entre les patients afin d’identifier des modèles qui peuvent ensuite réduire la durée de la méthode de recherche personnalisée.
  5. Tester et valider l’algorithme sur des ensembles de données combinés par bootstrap / autoamorçage.
  6. Retester l’outil en testant à nouveau un certain nombre de patients atteints d’EM/SFC pour déterminer si la signature produite est cohérente avec le passé.
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NMR Metabolomics
NMR (Nuclear Magnetic Resonance) is an instrument/tool used to perform metabolic studies, metabolic profiling, and metabolomics in biofluids and tissues for more than 40 years using magnetic fields. There is a very close connection between metabolic measurements and NMR. This connection has flourished because of NMR’s many unique strengths for characterizing complex mixtures’ chemical composition.
Protéomique

L'étude à grande échelle des protéines, qui sont de grandes molécules complexes nécessaires à la structure, à la fonction et à la régulation des tissus et des organes du corps humain.

Microvésicules et séquençage viral

Les microvésicules sont un type de vésicule extracellulaire qui est libérée de la membrane cellulaire. Les vésicules sont de petits sacs ou vacuoles remplis de liquide dans l'organisme. Le séquençage est une technique utilisée pour déterminer la séquence exacte des bases (A, C, G et T) dans une molécule d'ADN (ou virale).

Micro ARN

Les cellules utilisent le Micro ARN pour contrôler si un gène particulier produit trop, trop peu ou la quantité normale de sa protéine à un moment donné.

Autoanticorps

Les anticorps qui réagissent avec les molécules de l'organisme et qui sont présents chez les personnes en bonne santé sont appelés anticorps naturels ou auto-anticorps.

L'ADN extracellulaire pour la réactivation virale

L'ADN extracellulaire est souvent sécrété activement et est utilisé pour effectuer plusieurs tâches, offrant ainsi une cible ou un outil attrayant pour les applications biotechnologiques, médicales, environnementales et microbiologiques générales. Les virus sont des parasites intracellulaires qui dépendent dans une large mesure de la cellule hôte pour leur réplication. La réactivation virale se produit lorsqu'une réplication active du génome viral entraîne une infection lytique (dégradation de la cellule) caractérisée par la libération de nouvelles particules virales progénitrices (descendantes).

Profilage des cellules immunitaires

Le système immunitaire joue de nombreux rôles régulateurs importants dans le développement et la progression des maladies. Compte tenu de l'émergence de thérapies immunitaires efficaces, des prédicteurs fiables de la réponse sont nécessaires. Le profilage des cellules immunitaires détermine la réponse en évaluant les populations de cellules immunitaires provenant d'échantillons traités et non traités. Dans notre cas, nous évaluerons la réponse des globules blancs à l'infection virale en utilisant un procédé appelé "Cytof".

Génomique des leucocytes

Un leucocyte est une cellule incolore qui circule dans le sang et les liquides organiques et qui est impliqué dans la lutte contre les substances étrangères et les maladies. Un génome est l'ensemble du matériel génétique d'un organisme. La génomique est un domaine de la biologie qui se concentre sur la structure, la fonction, l'évolution, la cartographie et l'édition des génomes. Par conséquent, la génomique leucocytaire est l'étude de tout le matériel génétique des leucocytes.

Métabolomique

Métabolomique est une façon d'étudier le métabolisme, c'est-à-dire de mesurer les quantités de métabolites (petites molécules) produites par notre corps lorsque nous transformons les aliments en énergie et autres molécules dont nos cellules ont besoin pour survivre. La technologie métabolomique est "à grande échelle", ce qui signifie que plusieurs milliers de métabolites peuvent être mesurés à partir d'un seul échantillon, par exemple de sang ou d'urine.