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Facteurs de risques viraux dans l'EM/SFC

Objectif de l'étude

Ce projet vise à caractériser les facteurs viraux associés aux réponses immunitaires et à l’inflammation dans l’EM/SFC.

Chercheurs

  • Dawei Li, PhD
  • Ronald Davis, PhD

Mises à jour et perspectives

Hypothèse et description de l'étude

Les déclencheurs viraux de la réponse immunitaire dans l’EM/SFC ont longtemps été supposés mais restent mal compris. Les rétrovirus endogènes germinaux (RVE) et les infections virales somatiques ont tous deux un impact significatif sur la réponse immunitaire et sont étudiés depuis des années ; cependant, les études précédentes se sont principalement concentrées sur des agents pathogènes viraux couramment testés ou sur plusieurs candidats RVE connus. Il n’est pas surprenant de constater qu’aucun de ces pathogènes n’est commun aux patients atteints d’EM/SFC. Une analyse complète de l’ensemble du spectre des RVE et du virome est susceptible de modifier notre compréhension des rôles des RVE et des infections virales dans l’EM/SFC. Cette proposition vise à développer de nouveaux algorithmes pour étudier les contributions des RVE à l’échelle du génome et du virome humain à l’EM/SFC.

OBJECTIFS

Deux jeunes professionnels interculturels en blouse blanche discutent d'un système de micropuce tandis que l'un d'eux pointe du doigt l'écran de l'ordinateur

  1. Étudier les infections virales somatiques (telles que le virome humain et les infections virales à l’échelle du virome) et les séquences virales germinales (telles que les variantes de rétrovirus endogènes) dans les génomes des patients.
  2. Développer les méthodes analytiques basées sur un nouvel algorithme et l’appliquer à l’ensemble de données pilotes provenant de patients atteints d’EM/SFC.
  3. Identifier les facteurs viraux associés à l’EM/SFC et/ou aux phénotypes associés.
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Microvésicules et séquençage viral

Les microvésicules sont un type de vésicule extracellulaire qui est libérée de la membrane cellulaire. Les vésicules sont de petits sacs ou vacuoles remplis de liquide dans l'organisme. Le séquençage est une technique utilisée pour déterminer la séquence exacte des bases (A, C, G et T) dans une molécule d'ADN (ou virale).

NMR Metabolomics
NMR (Nuclear Magnetic Resonance) is an instrument/tool used to perform metabolic studies, metabolic profiling, and metabolomics in biofluids and tissues for more than 40 years using magnetic fields. There is a very close connection between metabolic measurements and NMR. This connection has flourished because of NMR’s many unique strengths for characterizing complex mixtures’ chemical composition.
Protéomique

L'étude à grande échelle des protéines, qui sont de grandes molécules complexes nécessaires à la structure, à la fonction et à la régulation des tissus et des organes du corps humain.

Autoanticorps

Les anticorps qui réagissent avec les molécules de l'organisme et qui sont présents chez les personnes en bonne santé sont appelés anticorps naturels ou auto-anticorps.

L'ADN extracellulaire pour la réactivation virale

L'ADN extracellulaire est souvent sécrété activement et est utilisé pour effectuer plusieurs tâches, offrant ainsi une cible ou un outil attrayant pour les applications biotechnologiques, médicales, environnementales et microbiologiques générales. Les virus sont des parasites intracellulaires qui dépendent dans une large mesure de la cellule hôte pour leur réplication. La réactivation virale se produit lorsqu'une réplication active du génome viral entraîne une infection lytique (dégradation de la cellule) caractérisée par la libération de nouvelles particules virales progénitrices (descendantes).

Profilage des cellules immunitaires

Le système immunitaire joue de nombreux rôles régulateurs importants dans le développement et la progression des maladies. Compte tenu de l'émergence de thérapies immunitaires efficaces, des prédicteurs fiables de la réponse sont nécessaires. Le profilage des cellules immunitaires détermine la réponse en évaluant les populations de cellules immunitaires provenant d'échantillons traités et non traités. Dans notre cas, nous évaluerons la réponse des globules blancs à l'infection virale en utilisant un procédé appelé "Cytof".

Génomique des leucocytes

Un leucocyte est une cellule incolore qui circule dans le sang et les liquides organiques et qui est impliqué dans la lutte contre les substances étrangères et les maladies. Un génome est l'ensemble du matériel génétique d'un organisme. La génomique est un domaine de la biologie qui se concentre sur la structure, la fonction, l'évolution, la cartographie et l'édition des génomes. Par conséquent, la génomique leucocytaire est l'étude de tout le matériel génétique des leucocytes.

Métabolomique

Métabolomique est une façon d'étudier le métabolisme, c'est-à-dire de mesurer les quantités de métabolites (petites molécules) produites par notre corps lorsque nous transformons les aliments en énergie et autres molécules dont nos cellules ont besoin pour survivre. La technologie métabolomique est "à grande échelle", ce qui signifie que plusieurs milliers de métabolites peuvent être mesurés à partir d'un seul échantillon, par exemple de sang ou d'urine.

Micro ARN

Les cellules utilisent le Micro ARN pour contrôler si un gène particulier produit trop, trop peu ou la quantité normale de sa protéine à un moment donné.