Approches multi-omiques pour résoudre les problèmes post-COVID-19 aigus (MOSAIC)
The purpose of this study is to facilitate early detection of ME/CFS in people with Long COVID and better understand disease progression.
Programme de recherche en médecine personnalisée de précision pour l’encéphalomyélite myalgique / syndrome de fatigue chronique (EM / SFC)
Créée en 2020, la Collaboration de Melbourne sur l’EM/SFC, dirigée par Christopher W. Armstrong, PhD, est un centre d’innovation et de collaboration en matière de recherche sur l’EM/SFC et les maladies apparentées.
L’intérêt du Dr Armstrong pour la recherche sur l’EM/SFC a été suscité par ses interactions avec les patients et les cliniciens au cours de son doctorat en biochimie à l’université de Melbourne, ce qui l’a amené à se consacrer à la compréhension de ces maladies complexes.
Son utilisation innovante de la métabolomique pour détecter les changements biochimiques chez les patients a été déterminante, attirant l’attention de Linda Tannenbaum lors d’une conférence et entraînant sa collaboration avec l’Open Medicine Foundation (OMF) en tant que collaborateur scientifique et chercheur invité à l’université de Stanford sous la direction de Ronald W. Davis. Cette collaboration a jeté les bases de l’OMF Australie, créée pour continuer à soutenir les recherches révolutionnaires de Chris à son retour à Melbourne.
La Collaboration de Melbourne sur l’EM/SFC vise à décrypter les voies biologiques communes de l’EM/SFC, en tenant compte de la diversité des manifestations de la maladie chez les patients. D’abord axée sur les études métaboliques, la collaboration se fait maintenant le champion de la médecine de précision pour comprendre la biologie unique de chaque patient. La stratégie du Dr Armstrong consiste à étendre les réseaux de recherche en Australie et dans le monde, à guider les nouveaux scientifiques dans ce domaine et à rapprocher les différents groupes de patients afin d’améliorer la compréhension collective. Sous la direction du Dr Armstrong, la Collaboration de Melbourne sur l’EM/SFC continue d’être à la pointe de la recherche, s’efforçant d’élucider les complexités de l’EM/SFC et d’ouvrir la voie à des interventions ciblées et à l’amélioration des résultats pour les patients.
The purpose of this study is to facilitate early detection of ME/CFS in people with Long COVID and better understand disease progression.
L’étude vise à comparer l’efficacité de différentes solutions salines, y compris un placebo, chez des personnes atteintes d’EM/SFC, de COVID longue et de POTS, afin de déterminer les formules les plus bénéfiques et de comprendre leur impact sur l’amélioration de la santé des patients.
L’étude vise à explorer les différences structurelles, neuro-vasculaires et biochimiques dans le cerveau des personnes atteintes d’EM/SFC, de COVID longue et de POTS afin d’élucider la pathologie sous-jacente et d’identifier des cibles potentielles pour des stratégies de traitement efficaces.
L’étude vise à caractériser en profondeur les patients avant, pendant et après l’essai des traitements par leur médecin généraliste. La production de données à grande échelle en combinaison avec les résultats du traitement sera utilisée pour produire un algorithme prédictif afin d’améliorer la connexion des patients aux options de traitement appropriées plus tôt.
L’étude vise à déterminer comment les fluctuations hormonales chez les personnes atteintes d’EM/SFC et de COVID longue, par rapport aux témoins en bonne santé, influencent le métabolisme et les voies immunitaires en mesurant les hormones, les métabolites et les marqueurs d’inflammation dans des échantillons de biofluides.
L’étude vise à examiner les effets de l’exercice en position couchée ou debout sur le flux sanguin cérébral, la pression artérielle, la fréquence cardiaque et la présence d’auto-anticorps chez les patients atteints d’EM/SFC présentant une intolérance orthostatique, par rapport aux témoins, afin de comprendre les mécanismes sous-jacents et les différences dans la gravité des symptômes et le malaise post-effort.
L’étude vise à comparer les marqueurs biologiques lors de symptômes légers et d’épisodes de crise/ MPE chez des personnes atteintes d’EM/SFC, ainsi que de borréliose de Lyme et de COVID longue en utilisant des échantillons de sang prélevés au doigt et des données continues provenant de capteurs portables afin de comprendre la variabilité des symptômes.
L’étude vise à analyser méticuleusement les changements quotidiens des métabolites à partir d’échantillons de sang de personnes atteintes d’EM/SFC pendant 25 jours, afin de découvrir les processus biologiques complexes contribuant à la maladie et de faciliter le regroupement des patients en fonction des changements dynamiques, relevant ainsi le défi de la diversité clinique et biologique au sein de la population atteinte d’EM/SFC.
L’étude vise à utiliser la biobanque australienne de l’EM/SFC pour des analyses métabolomiques et d’autres essais afin d’identifier des biomarqueurs potentiels de l’encéphalomyélite myalgique/syndrome de fatigue chronique, contribuant ainsi à un ensemble de données complet pour une analyse à grande échelle.
Cette étude vise à comprendre les mécanismes biologiques à l’origine de la symptomatologie de l’encéphalomyélite myalgique/syndrome de fatigue chronique (EM/SFC) à l’aide d’analyses métabolomiques et lipidomiques à haut débit et de prélèvements sanguins à haute fréquence sur une période de 6,5 à 7,5 heures effectués sur deux sites distincts (Melbourne et Uppsala).
Cette étude portera sur les signatures métaboliques des échantillons de selles, d’urine et de sang des patients atteints d’EM/SFC et sur l’impact des comorbidités (syndrome de l’intestin irritable et fibromyalgie) sur ces signatures.
Ce projet a pour but d’étudier les pièges métaboliques dans le métabolisme central du carbone qui conduisent aux voies de production d’énergie altérées observées dans l’EM/SFC.
Ce projet développera un outil logiciel pour rechercher rapidement les anomalies du métabolisme d’un individu qui pourraient être expliquées par ses gènes. Il recherchera également des gènes potentiellement néfastes chez les individus et tentera de regrouper les patients atteints d’EM/SFC sur la base de leurs profils génétiques et métaboliques.
Ce projet vise à tester l’hypothèse de l’azote, selon laquelle les sous-produits nocifs du métabolisme énergétique contenant de l’azote s’accumulent plus facilement dans les cellules des patients atteints d’EM/SFC.
L’objectif de ce projet est de caractériser de manière exhaustive les modifications des mouvements oculaires dans l’EM/SFC sur deux jours consécutifs, afin d’identifier une signature motrice oculaire propre à la maladie.
Cette étude vise à comprendre les mécanismes pathologiques de l’EM/SFC pédiatrique (13 à 18 ans), en utilisant un modèle d’étude cas-témoins et longitudinal qui combine des mesures cliniques et des méthodes omique.
L’objectif de cette recherche est de révéler plus d’informations sur le rôle de l’immunologie et de la neuroinflammation dans l’EM/SFC, ainsi que sur les mécanismes sous-jacents de la pathogenèse qui s’y rattache.
Collaborer avec les CRC de l’OMF à Uppsala et Melbourne pour établir une perspective globale. Décoder les mécanismes moléculaires qui sous-tendent l’EM/SFC et contribuent à des symptômes spécifiques, en mettant l’accent sur le malaise post-effort (MPE) :Phénotypage approfondi des patients atteints d’EM, et établissement du profil protéomique plasmatique/métabolomique global des patients atteints d’EM.
L’objectif de cette étude est d’évaluer de manière générale les sous-ensembles de cellules B, leur métabolisme, leur viabilité, leurs récepteurs et leurs anticorps chez les personnes atteintes d’EM/SFC.
Pour mener à bien ces projets ambitieux, le Dr Armstrong met en place des réseaux et des collaborations qui s’étendent aux États-Unis, au Royaume-Uni, à la Suède et à d’autres institutions australiennes.
University of Melbourne, Australia
Paul Gooley, PhD
Natalie Thomas, PhD
Kathy Huang
Amber Jaa-Kwee
Elena Christopolous
Xiaoyun Wang, PhD
David Fineberg, MBBS, FRACGP, DCH
Neil McGregor, PhD
David Ascher, PhD
Elisha Josev, PhD
Sarah Knight, PhD
Adam Scheinberg, FRACP, FAFRM, MMed(ClinEpi)
Elena Schneider-Futschik, PhD
Kristin Brown, PhD
Michael Menden, PhD
Leigh Johnston, PhD
Rebecca Glarin, BApSc, PGDip(MRI)
Rob Williams
Bradford Moffat, PhD
Christopher Rowe, BMBS, FRACP, MD, FAANMS
Stanford University, USA
Ronald Davis, PhD
Michael Snyder, PhD
Robert Phair, PhD
Laurel Crosby, PhD
Jaime Seltzer
Linda Lan, PhD
Yue Wu, PhD
Jessi Li
Longsha, Liu
Harvard-Affiliated Hospitals, USA
David Systrom, MD
Wenzhong Xiao, PhD
Uppsala University, Sweden
Jonas Bergquist, MD, PhD
University of Montreal, Canada
Alain Moreau, PhD
University of Alabama Birmingham, USA
Jarred Younger, PhD
University College London, UK
Jo Cambridge, PhD
Massachusetts Institute of Technology, USA
Michal Tal, PhD
Beth Pollack
La Trobe University, Australia
Sarah Annesley, PhD
Paul Fisher, PhD
Daniel Missailidis, PhD
Australian National University, Australia
Brett Lidbury, PhD
Alice Richardson, PhD
Monash University, Australia
Joanne Fielding, PhD
Meaghan Clough, PhD
Caroline Gurvich, Dpsych
Jade Bartholomew
Macquarie University, Australia
Benjamin Heng, PhD
Baker Institute, Australia
Keegan Moneghetti, FRACP, PhD
Murdoch Children’s Research Institute, Australia
Tracey Chau, PhD
Victoria University, Australia
Joshua Johnson, PhD
South Australian Health and Medical Research Institute (SAHMRI), Australia
Martin Lewis, PhD
Michael Musker, PhD
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Les microvésicules sont un type de vésicule extracellulaire qui est libérée de la membrane cellulaire. Les vésicules sont de petits sacs ou vacuoles remplis de liquide dans l'organisme. Le séquençage est une technique utilisée pour déterminer la séquence exacte des bases (A, C, G et T) dans une molécule d'ADN (ou virale).
L'étude à grande échelle des protéines, qui sont de grandes molécules complexes nécessaires à la structure, à la fonction et à la régulation des tissus et des organes du corps humain.
Les anticorps qui réagissent avec les molécules de l'organisme et qui sont présents chez les personnes en bonne santé sont appelés anticorps naturels ou auto-anticorps.
L'ADN extracellulaire est souvent sécrété activement et est utilisé pour effectuer plusieurs tâches, offrant ainsi une cible ou un outil attrayant pour les applications biotechnologiques, médicales, environnementales et microbiologiques générales. Les virus sont des parasites intracellulaires qui dépendent dans une large mesure de la cellule hôte pour leur réplication. La réactivation virale se produit lorsqu'une réplication active du génome viral entraîne une infection lytique (dégradation de la cellule) caractérisée par la libération de nouvelles particules virales progénitrices (descendantes).
Le système immunitaire joue de nombreux rôles régulateurs importants dans le développement et la progression des maladies. Compte tenu de l'émergence de thérapies immunitaires efficaces, des prédicteurs fiables de la réponse sont nécessaires. Le profilage des cellules immunitaires détermine la réponse en évaluant les populations de cellules immunitaires provenant d'échantillons traités et non traités. Dans notre cas, nous évaluerons la réponse des globules blancs à l'infection virale en utilisant un procédé appelé "Cytof".
Un leucocyte est une cellule incolore qui circule dans le sang et les liquides organiques et qui est impliqué dans la lutte contre les substances étrangères et les maladies. Un génome est l'ensemble du matériel génétique d'un organisme. La génomique est un domaine de la biologie qui se concentre sur la structure, la fonction, l'évolution, la cartographie et l'édition des génomes. Par conséquent, la génomique leucocytaire est l'étude de tout le matériel génétique des leucocytes.
Métabolomique est une façon d'étudier le métabolisme, c'est-à-dire de mesurer les quantités de métabolites (petites molécules) produites par notre corps lorsque nous transformons les aliments en énergie et autres molécules dont nos cellules ont besoin pour survivre. La technologie métabolomique est "à grande échelle", ce qui signifie que plusieurs milliers de métabolites peuvent être mesurés à partir d'un seul échantillon, par exemple de sang ou d'urine.
Les cellules utilisent le Micro ARN pour contrôler si un gène particulier produit trop, trop peu ou la quantité normale de sa protéine à un moment donné.