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Myalgic Encephalomyelitis / Chronic Fatigue Syndrome (ME / CFS) Post Treatment Lyme Disease Syndrome (PTLDS), Fibromyalgia Leading Research. Delivering Hope.Open Medicine Foundation® Canada
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Découverte de biomarqueurs basés sur la spectrométrie pour l'encéphalomyélite myalgique- RAman SPectrometry Based biomarkER discoveRY for Myalgic Encephalomyelitis (RASPBERRY-ME)

BUT DE L’ÉTUDE
L'objectif principal du projet RASPBERRY-ME est la caractérisation de la signature biomoléculaire de l'encéphalomyélite myalgique à l'aide de la spectroscopie Raman sans étiquette (RS) et de modèles d'apprentissage automatique.
CHERCHEURS PRINCIPAUX
  • Alain Moreau, PhD
  • Mathieu Dehaes, PhD
  • Frédéric Leblond, PhD
RÉVISIONS ET POTENTIEL
  • L’acquisition des données du spectromètre Raman pour l’ensemble de la cohorte a été achevée.
  • L’analyse préliminaire est terminée sur les échantillons de plasma de 15 patients atteints d’EM/SFC et de 23 témoins en bonne santé sédentaires.
  • Des techniques d’apprentissage automatique ont été employées pour identifier des caractéristiques significatives permettant de différencier les patients atteints d’EM/SFC des témoins en bonne santé au départ.

HYPOTHÈSE D’ÉTUDE ET DESCRIPTION

Une chercheuse travaillant avec un ordinateur dans un laboratoire. Deux collègues sont visibles en arrière-plan

La spectroscopie Raman est une technique non-destructive, rapide et peu coûteuse qui permet d’étudier la composition moléculaire des fluides biologiques comme le sang, ou à l’intérieur d’une cellule lorsqu’elle est combinée à la microscopie confocale. Cette approche innovante pourrait conduire au développement d’outils de diagnostic pour mieux classifier les patients atteints d’EM et trouver les causes sous-jacentes de différents symptômes comme le malaise post-effort, ainsi que d’outils cliniques pour valider le potentiel thérapeutique de traitements pharmacologiques pour traiter, enrayer ou atténuer l’EM grâce à la médecine de précision.

Nous supposons que notre approche permettra l’identification d’une signature biomoléculaire de l’EM à la fois au départ et en réponse à l’application d’un défi de stress post-effort. Nous espérons pouvoir stratifier les patients en différenciant les cas graves des formes légères d’EM. Les résultats de cette étude seront combinés aux approches de profilage protéomique et métabolomique en cours afin de mieux comprendre la pathophysiologie de l’EM.

Objective

  1. Caractériser la signature biomoléculaire des patients atteints d’EM et des témoins en bonne santé appariés en âge en utilisant la spectroscopie Raman sans étiquette dans les échantillons de plasma acquis au départ et après l’induction du MPE.
  2. Déterminer les altérations des métabolites cellulaires entre les patients atteints d’EM et les témoins appariés en âge en utilisant la spectroscopie Raman combinée à la microscopie confocale dans les cellules mononucléaires du sang périphérique acquises au départ et après l’induction de la MPE.
  3. Développer des modèles de détection des caractéristiques moléculaires et d’apprentissage automatique capables de prédire la réponse au MPE (au départ vs. après le test de stress) et la maladie (EM vs. contrôle).
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Microvésicules et séquençage viral

Les microvésicules sont un type de vésicule extracellulaire qui est libérée de la membrane cellulaire. Les vésicules sont de petits sacs ou vacuoles remplis de liquide dans l'organisme. Le séquençage est une technique utilisée pour déterminer la séquence exacte des bases (A, C, G et T) dans une molécule d'ADN (ou virale).

NMR Metabolomics
NMR (Nuclear Magnetic Resonance) is an instrument/tool used to perform metabolic studies, metabolic profiling, and metabolomics in biofluids and tissues for more than 40 years using magnetic fields. There is a very close connection between metabolic measurements and NMR. This connection has flourished because of NMR’s many unique strengths for characterizing complex mixtures’ chemical composition.
Protéomique

L'étude à grande échelle des protéines, qui sont de grandes molécules complexes nécessaires à la structure, à la fonction et à la régulation des tissus et des organes du corps humain.

Autoanticorps

Les anticorps qui réagissent avec les molécules de l'organisme et qui sont présents chez les personnes en bonne santé sont appelés anticorps naturels ou auto-anticorps.

L'ADN extracellulaire pour la réactivation virale

L'ADN extracellulaire est souvent sécrété activement et est utilisé pour effectuer plusieurs tâches, offrant ainsi une cible ou un outil attrayant pour les applications biotechnologiques, médicales, environnementales et microbiologiques générales. Les virus sont des parasites intracellulaires qui dépendent dans une large mesure de la cellule hôte pour leur réplication. La réactivation virale se produit lorsqu'une réplication active du génome viral entraîne une infection lytique (dégradation de la cellule) caractérisée par la libération de nouvelles particules virales progénitrices (descendantes).

Profilage des cellules immunitaires

Le système immunitaire joue de nombreux rôles régulateurs importants dans le développement et la progression des maladies. Compte tenu de l'émergence de thérapies immunitaires efficaces, des prédicteurs fiables de la réponse sont nécessaires. Le profilage des cellules immunitaires détermine la réponse en évaluant les populations de cellules immunitaires provenant d'échantillons traités et non traités. Dans notre cas, nous évaluerons la réponse des globules blancs à l'infection virale en utilisant un procédé appelé "Cytof".

Génomique des leucocytes

Un leucocyte est une cellule incolore qui circule dans le sang et les liquides organiques et qui est impliqué dans la lutte contre les substances étrangères et les maladies. Un génome est l'ensemble du matériel génétique d'un organisme. La génomique est un domaine de la biologie qui se concentre sur la structure, la fonction, l'évolution, la cartographie et l'édition des génomes. Par conséquent, la génomique leucocytaire est l'étude de tout le matériel génétique des leucocytes.

Métabolomique

Métabolomique est une façon d'étudier le métabolisme, c'est-à-dire de mesurer les quantités de métabolites (petites molécules) produites par notre corps lorsque nous transformons les aliments en énergie et autres molécules dont nos cellules ont besoin pour survivre. La technologie métabolomique est "à grande échelle", ce qui signifie que plusieurs milliers de métabolites peuvent être mesurés à partir d'un seul échantillon, par exemple de sang ou d'urine.

Micro ARN

Les cellules utilisent le Micro ARN pour contrôler si un gène particulier produit trop, trop peu ou la quantité normale de sa protéine à un moment donné.