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Études omiques de l'iCPET/ épreuve d’effort cardio-pulmonaire invasive sur l'EM/SFC

BUT DE L’ÉTUDE

Cette étude de Harvard évalue les différentes explications de l’insuffisance cardiaque de précharge chez les patients atteints d’EM/SFC afin de déterminer laquelle est active chez de nombreux patients atteints d’EM/SFC, voire chez tous. Le Centre de calcul cherche maintenant à mieux comprendre les causes de l’EM/SFC (Insuffisance cardiaque de précharge, la forme à débit élevé) ainsi qu’à identifier des cibles médicamenteuses potentielles pour de futures thérapies.

CHERCHEURS PRINCIPAUX
  • Wenzhong Xiao, PhD
Mises à jour et perspectives
  • Les données des études omiques de l’iCPET/ épreuve d’effort cardio-pulmonaire invasive sur l’EM/SFC (cytokines, métabolites et protéines provenant du sang artériel pulmonaire et du sang artériel radial) sont complètes.
  • L’analyse informatique et la préparation des articles sont en cours.
  • Une réponse accrue des cytokines pro-inflammatoires a été identifiée entre les artères pulmonaires et radiales chez les patients par rapport aux témoins symptomatiques.
  • La réponse métabolique des petites molécules à l’exercice semble comparable ou exagérée entre les patients atteints d’EM/SFC et les témoins symptomatiques, selon l’approche informatique.
  • Des profils protéomiques des artères radiales et pulmonaires ont été obtenus. Identification de la signature de trois protéines qui distinguent l’EM/SFC des témoins.  Planification d’une étude de vérification de la signature protéomique.
HYPOTHÈSE ET DESCRIPTION DE L'ÉTUDE

À l’aide d’un recueil de plasma provenant de plus de 300 patients atteints d’EM/SFC, les chercheurs ont identifié une forme d’insuffisance cardiaque appelée « insuffisance cardiaque de précharge » (ICP). Elle se présente sous deux formes : à faible débit et à débit élevé. Nombre de ces patients souffrent de dysautonomie et beaucoup ont été diagnostiqués comme souffrant du syndrome de tachycardie orthostatique posturale (POTS), un syndrome qui implique à la fois le système cardio-pulmonaire et le système vasculaire périphérique, modulés par le système nerveux autonome. On ne sait pas pourquoi ces systèmes sont déréglés, ce qui provoque des vertiges, de la fatigue, une incapacité à faire des efforts physiques, des étourdissements, des évanouissements et parfois une accélération du rythme cardiaque, des nausées, de l’anxiété et des troubles de la vision. Il est probable qu’une étude approfondie de l’interaction de ces systèmes permettra de mieux comprendre l’origine de ce dérèglement.

Nous espérons que ces études menées sur des patients atteints d’EM/SFC soumis à une épreuve d’effort cardio-pulmonaire permettront d’élargir la base de données biologiques et de mieux comprendre les causes de l’EM/SFC (Insuffisance de précharge cardiaque à débit élevé), ainsi que d’identifier des cibles médicamenteuses potentielles pour de futures thérapies.

DÉROULEMENT DE L'ÉTUDE
  1. Analyser les données collectées tout au long de l’étude.
  2. Identifier les différences métabolomiques, protéomiques et les marqueurs inflammatoires dans le sang des patients atteints d’insuffisance cardiaque de précharge et d’un diagnostic d’EM/SFC.
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Microvésicules et séquençage viral

Les microvésicules sont un type de vésicule extracellulaire qui est libérée de la membrane cellulaire. Les vésicules sont de petits sacs ou vacuoles remplis de liquide dans l'organisme. Le séquençage est une technique utilisée pour déterminer la séquence exacte des bases (A, C, G et T) dans une molécule d'ADN (ou virale).

NMR Metabolomics
NMR (Nuclear Magnetic Resonance) is an instrument/tool used to perform metabolic studies, metabolic profiling, and metabolomics in biofluids and tissues for more than 40 years using magnetic fields. There is a very close connection between metabolic measurements and NMR. This connection has flourished because of NMR’s many unique strengths for characterizing complex mixtures’ chemical composition.
Protéomique

L'étude à grande échelle des protéines, qui sont de grandes molécules complexes nécessaires à la structure, à la fonction et à la régulation des tissus et des organes du corps humain.

Génomique des leucocytes

Un leucocyte est une cellule incolore qui circule dans le sang et les liquides organiques et qui est impliqué dans la lutte contre les substances étrangères et les maladies. Un génome est l'ensemble du matériel génétique d'un organisme. La génomique est un domaine de la biologie qui se concentre sur la structure, la fonction, l'évolution, la cartographie et l'édition des génomes. Par conséquent, la génomique leucocytaire est l'étude de tout le matériel génétique des leucocytes.

Métabolomique

Métabolomique est une façon d'étudier le métabolisme, c'est-à-dire de mesurer les quantités de métabolites (petites molécules) produites par notre corps lorsque nous transformons les aliments en énergie et autres molécules dont nos cellules ont besoin pour survivre. La technologie métabolomique est "à grande échelle", ce qui signifie que plusieurs milliers de métabolites peuvent être mesurés à partir d'un seul échantillon, par exemple de sang ou d'urine.

Micro ARN

Les cellules utilisent le Micro ARN pour contrôler si un gène particulier produit trop, trop peu ou la quantité normale de sa protéine à un moment donné.

Autoanticorps

Les anticorps qui réagissent avec les molécules de l'organisme et qui sont présents chez les personnes en bonne santé sont appelés anticorps naturels ou auto-anticorps.

L'ADN extracellulaire pour la réactivation virale

L'ADN extracellulaire est souvent sécrété activement et est utilisé pour effectuer plusieurs tâches, offrant ainsi une cible ou un outil attrayant pour les applications biotechnologiques, médicales, environnementales et microbiologiques générales. Les virus sont des parasites intracellulaires qui dépendent dans une large mesure de la cellule hôte pour leur réplication. La réactivation virale se produit lorsqu'une réplication active du génome viral entraîne une infection lytique (dégradation de la cellule) caractérisée par la libération de nouvelles particules virales progénitrices (descendantes).

Profilage des cellules immunitaires

Le système immunitaire joue de nombreux rôles régulateurs importants dans le développement et la progression des maladies. Compte tenu de l'émergence de thérapies immunitaires efficaces, des prédicteurs fiables de la réponse sont nécessaires. Le profilage des cellules immunitaires détermine la réponse en évaluant les populations de cellules immunitaires provenant d'échantillons traités et non traités. Dans notre cas, nous évaluerons la réponse des globules blancs à l'infection virale en utilisant un procédé appelé "Cytof".