Recherche sur l'encéphalomyélite myalgique / le syndrome de fatigue chronique (EM / SFC), le syndrome post-traitement de la maladie de Lyme (PTLDS), la fibromyalgie et le syndrome post-COVID .

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Profils détaillés du protéome et du métabolome

OBJECTIF DE L'ÉTUDE
Collaborer avec les CRC de l’OMF à Uppsala et Melbourne pour établir une perspective globale.   Décoder les mécanismes moléculaires qui sous-tendent l’EM/SFC et contribuent à des symptômes spécifiques, en mettant l’accent sur le malaise post-effort (MPE) :
  • Phénotypage approfondi des patients atteints d’EM
  • Établissement du profil protéomique plasmatique global des patients atteints d’EM
  • Établissement du profil plasmatique métabolomique global des patients atteints d’EM.
CHERCHEURS PRINCIPAUX
    • Alain Moreau, PhD
    • Jonas Bergquist, MD, PhD
    • Chris Armstrong, PhD
    • Neil McGregor, BDS, MDSc, PhD
MISES À JOUR ET PERSPECTIVES
  • 162 échantillons ont été reçus et pré-traités, et les étapes de nettoyage sont terminées.
  • Les échantillons ont été distribués aux centres d’Uppsala et de Melbourne.
  • Il est prévu d’effectuer une analyse protéomique à grande échelle – elle devrait prendre fin au printemps ou au début de l’été 2022.
HYPOTHÈSE ET DESCRIPTION DE L'ÉTUDE
En tirant parti de notre expertise dans l’écosystème de l’Open Medicine Foundation et grâce à un partenariat unique entre trois centres de recherche Collaborative EM/SFC de l’OMF (Melbourne, Montréal et Uppsala), notre équipe de recherche examinera les liens entre les molécules circulant dans le sang et l’EM. Ce projet permettra de mieux comprendre pourquoi certains patients atteints d’EM présentent des symptômes différents et comment le malaise post-effort exacerbe de nombreux symptômes. L’identification de biomarqueurs spécifiques contribuera au développement de la prédiction du risque de complications associées à l’EM, à la prévention précoce et à l’élaboration de meilleurs traitements pour atténuer les symptômes les plus graves, ce qui pourra éventuellement conduire à de nouvelles approches thérapeutiques pour guérir l’EM. Aucune approche mono-omique ne peut élucider complètement la multitude d’altérations qui se produisent dans l’EM. Le projet DOMINO-ME associera une caractérisation phénotypique approfondie des patients atteints d’EM à des stratégies de découverte non biaisées en combinant des profils protéomiques et métabolomiques globaux d’échantillons de plasma pour découvrir la pathogenèse de l’EM.
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NMR Metabolomics
NMR (Nuclear Magnetic Resonance) is an instrument/tool used to perform metabolic studies, metabolic profiling, and metabolomics in biofluids and tissues for more than 40 years using magnetic fields. There is a very close connection between metabolic measurements and NMR. This connection has flourished because of NMR’s many unique strengths for characterizing complex mixtures’ chemical composition.
Protéomique

L'étude à grande échelle des protéines, qui sont de grandes molécules complexes nécessaires à la structure, à la fonction et à la régulation des tissus et des organes du corps humain.

Microvésicules et séquençage viral

Les microvésicules sont un type de vésicule extracellulaire qui est libérée de la membrane cellulaire. Les vésicules sont de petits sacs ou vacuoles remplis de liquide dans l'organisme. Le séquençage est une technique utilisée pour déterminer la séquence exacte des bases (A, C, G et T) dans une molécule d'ADN (ou virale).

Micro ARN

Les cellules utilisent le Micro ARN pour contrôler si un gène particulier produit trop, trop peu ou la quantité normale de sa protéine à un moment donné.

Autoanticorps

Les anticorps qui réagissent avec les molécules de l'organisme et qui sont présents chez les personnes en bonne santé sont appelés anticorps naturels ou auto-anticorps.

L'ADN extracellulaire pour la réactivation virale

L'ADN extracellulaire est souvent sécrété activement et est utilisé pour effectuer plusieurs tâches, offrant ainsi une cible ou un outil attrayant pour les applications biotechnologiques, médicales, environnementales et microbiologiques générales. Les virus sont des parasites intracellulaires qui dépendent dans une large mesure de la cellule hôte pour leur réplication. La réactivation virale se produit lorsqu'une réplication active du génome viral entraîne une infection lytique (dégradation de la cellule) caractérisée par la libération de nouvelles particules virales progénitrices (descendantes).

Profilage des cellules immunitaires

Le système immunitaire joue de nombreux rôles régulateurs importants dans le développement et la progression des maladies. Compte tenu de l'émergence de thérapies immunitaires efficaces, des prédicteurs fiables de la réponse sont nécessaires. Le profilage des cellules immunitaires détermine la réponse en évaluant les populations de cellules immunitaires provenant d'échantillons traités et non traités. Dans notre cas, nous évaluerons la réponse des globules blancs à l'infection virale en utilisant un procédé appelé "Cytof".

Génomique des leucocytes

Un leucocyte est une cellule incolore qui circule dans le sang et les liquides organiques et qui est impliqué dans la lutte contre les substances étrangères et les maladies. Un génome est l'ensemble du matériel génétique d'un organisme. La génomique est un domaine de la biologie qui se concentre sur la structure, la fonction, l'évolution, la cartographie et l'édition des génomes. Par conséquent, la génomique leucocytaire est l'étude de tout le matériel génétique des leucocytes.

Métabolomique

Métabolomique est une façon d'étudier le métabolisme, c'est-à-dire de mesurer les quantités de métabolites (petites molécules) produites par notre corps lorsque nous transformons les aliments en énergie et autres molécules dont nos cellules ont besoin pour survivre. La technologie métabolomique est "à grande échelle", ce qui signifie que plusieurs milliers de métabolites peuvent être mesurés à partir d'un seul échantillon, par exemple de sang ou d'urine.