Recherche sur l'encéphalomyélite myalgique / le syndrome de fatigue chronique (EM / SFC), le syndrome post-traitement de la maladie de Lyme (PTLDS), la fibromyalgie et le syndrome post-COVID .

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Étude sur la transition de la COVID longue en EM/SFC

OBJECTIF DE L'ÉTUDE

L’OMF a obtenu une subvention d’un million de dollars pour lancer la première année d’une étude internationale et pluriannuelle dans les six centres de recherche collaborative (CRC) soutenus par l’OMF.  L’objectif de cette étude est d’examiner la transition de la COVID longue à l’EM/SFC.

CHERCHEURS PRINCIPAUX
  • Ronald W. Davis, PhD
  • Wenzhong Xiao, PhD
  • David Systrom, MD
  • Jonas Bergquist, MD, PhD
  • Alain Moreau, PhD
  • Chris Armstrong, PhD
HYPOTHÈSE ET DESCRIPTION DE L'ÉTUDE

L’OMF a réuni son réseau mondial de collaboration, à travers 6 centres de recherche, pour mener à bien cet effort mondial en plusieurs étapes, grâce à une subvention de 1 000 000 $ accordée spécifiquement pour cet objectif. Nous travaillons activement à la recherche de fonds supplémentaires pour poursuivre cette étude essentielle.

Les chercheurs testent et analysent les données des malades depuis l’apparition de la COVID-19 jusqu’à leur guérison ou leur état de maladie prolongée. Cette étude a la possibilité de révéler ce qui fait qu’une personne se rétablit complètement par rapport aux personnes à haut risque de développer l’EM/SFC.

Ces données seront comparées à celles de l’étude sur les complications post-virales de l’encéphalite herpétique (à Herpès simplex), financée par l’OMF, afin de fournir un autre contraste post-viral. Cette conception de l’étude offre la possibilité d’élucider les mécanismes pathologiques précis de l’EM/SFC et d’autres maladies post-virales, non compliquées par des facteurs associés à la chronicité de la maladie, l’identification potentielle de biomarqueurs diagnostiques et de cibles potentielles pour le développement de traitements pour l’avenir.

OBJECTIFS

  • Collecter des données tout au long de l’étude longitudinale
  • Identifier les marqueurs de l’expression génétique qui sont prédictifs d’un lent rétablissement ou d’une maladie prolongée.
  • Analyser les marqueurs d’inflammation dans le plasma sanguin et le liquide céphalo-rachidien.
  • Analyser la métabolomique à partir d’échantillons d’urine et de plasma sanguin.
  • Rassembler l’ensemble des données biologiques recueillies pour déterminer les marqueurs prédictifs précoces de l’EM/SFC après un déclenchement viral important.
  • Réaliser une étude des profils d’expression des microARN circulants à l’échelle mondiale.
  • Réaliser un profilage global de la méthylation de l’ADN.
  • Réaliser une analyse d’association à l’échelle de l’épigénome
MISES À JOUR ET PERSPECTIVES

Mises à jour de la phase 1

  • Toutes les études omiques initiales post COVID (acides nucléiques, protéines et métabolites dans le LCR et le sang des patients COVID, et encéphalite herpétique) ont été entreprises avec des ensembles de données reçus d’Uppsala, Harvard et Stanford.
  • L’analyse informatique de tous les ensembles de données est en cours et sera publiée lorsqu’elle sera terminée.
  • La collecte d’échantillons longitudinaux se poursuivra parallèlement à d’autres analyses.

Mises à jour provenant du service de soins pour les patients atteints de la COVID longue à Uppsala

  • Une nouvelle unité de soins pour les patients présentant des complications liées à la COVID longue a été ouverte à Uppsala.* Elle poursuivra le travail de l’étude collaborative multicentrique financée par l’OMF sur l’évolution de la COVID vers l’EM/SFC.
  • Plus de 1500 patients présentant une COVID initialement moins grave mais avec des séquelles sérieuses et des complications post-COVID sont inscrits avec des questionnaires à remplir.
  • La consultation permet de poursuivre l’étude du processus pathologique au fur et à mesure de son évolution et, espérons-le, de mieux comprendre l’EM/SFC.  Un sous-ensemble de patients précédemment gravement malades sera suivi pour l’évolution de la maladie au fil du temps, aux côtés de patients souffrant de Covid longue non gravement malades qui se rendront également à la clinique pour des symptômes persistants.
  • Un IRB supplémentaire a été approuvé pour permettre le prélèvement de sang et l’analyse de l’ARN, de la protéomique et de la métabolomique.
  • Prochaines étapes : L’ARN (dans les cellules sanguines isolées en utilisant un gradient de Ficoll), la protéomique et la métabolomique (plasma) seront analysés.
  • Les données cliniques sont compilées en permanence et seront envoyées au centre de calcul pour être corrélées avec les biomarqueurs.
  • Comme pour la phase 1 de l’étude, les chercheurs utiliseront la génomique, la protéomique, la métabolomique et l’immunologie pour récupérer le plus grand nombre possible de cellules immunitaires et caractériser leur évolution vers l’EM/SFC. De plus, nous étudions le plasma et le liquide céphalorachidien (LCR) pour identifier les protéines et les grosses molécules (par exemple, les anticorps) ainsi que les petites molécules qui apparaissent ou disparaissent en association avec le développement de l’EM/SFC.

Dernières mises à jour de Montréal

  • Développement d’un algorithme utilisant notre panel diagnostique de 11 microARN permettant la stratification des patients atteints d’EM/SFC selon différentes trajectoires de séquelles à long terme :
    • EM, EM+FM ou FM
    • Dysfonctionnement respiratoire sévère
    • Neurologique
    • Liées à l’allergie
  • Les évaluations neurocognitives BrainCheck avant et après l’induction du MPE nous ont permis de stratifier les patients atteints de COVID longue en quatre groupes à l’aide d’une méthode d’apprentissage automatique.
  • Les patients classés dans les groupes A et B présentent un profil neurocognitif souvent observé chez les patients atteints d’EM/SFC, tandis que les patients atteints de COVID longue dans les groupes C et D présentent plus souvent des séquelles neurologiques.
  • Les résultats préliminaires suggèrent que les patients atteints de COVID longue durée du groupe B présentent une meilleure récupération de leur fonction neurocognitive que ceux du groupe A ou C.
  • Prochaines étapes : Valider ces résultats dans une cohorte plus importante.

 

Dernières mises à jour du Centre informatique

  • L’étude COVID est en cours avec des données omiques (acides nucléiques, protéines et métabolites dans le sang) et les informations cliniques associées des unités de soins intensifs reçues d’Uppsala et de Stanford. Des données sur les résultats à long terme des patients seront reçues.
  • L’analyse des séquences de l’ARN et de l’ADN viraux a révélé des réactivations de l’EBV et de l’HHV6 chez les patients de l’unité de soins intensifs COVID.
  • L’analyse informatique a permis d’identifier des métabolites précoces associés à l’évolution de l’état des patients en soins intensifs.
  • L’analyse des protéines dans le liquide céphalorachidien des patients des unités de soins intensifs, des patients atteints d’EM/SFC et des témoins a permis d’identifier des schémas uniques dans chaque groupe.
  • Une analyse plus poussée permettra d’établir une corrélation entre les schémas omiques et les patients atteints de COVID longue.
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Protéomique

L'étude à grande échelle des protéines, qui sont de grandes molécules complexes nécessaires à la structure, à la fonction et à la régulation des tissus et des organes du corps humain.

Microvésicules et séquençage viral

Les microvésicules sont un type de vésicule extracellulaire qui est libérée de la membrane cellulaire. Les vésicules sont de petits sacs ou vacuoles remplis de liquide dans l'organisme. Le séquençage est une technique utilisée pour déterminer la séquence exacte des bases (A, C, G et T) dans une molécule d'ADN (ou virale).

NMR Metabolomics
NMR (Nuclear Magnetic Resonance) is an instrument/tool used to perform metabolic studies, metabolic profiling, and metabolomics in biofluids and tissues for more than 40 years using magnetic fields. There is a very close connection between metabolic measurements and NMR. This connection has flourished because of NMR’s many unique strengths for characterizing complex mixtures’ chemical composition.
Autoanticorps

Les anticorps qui réagissent avec les molécules de l'organisme et qui sont présents chez les personnes en bonne santé sont appelés anticorps naturels ou auto-anticorps.

L'ADN extracellulaire pour la réactivation virale

L'ADN extracellulaire est souvent sécrété activement et est utilisé pour effectuer plusieurs tâches, offrant ainsi une cible ou un outil attrayant pour les applications biotechnologiques, médicales, environnementales et microbiologiques générales. Les virus sont des parasites intracellulaires qui dépendent dans une large mesure de la cellule hôte pour leur réplication. La réactivation virale se produit lorsqu'une réplication active du génome viral entraîne une infection lytique (dégradation de la cellule) caractérisée par la libération de nouvelles particules virales progénitrices (descendantes).

Profilage des cellules immunitaires

Le système immunitaire joue de nombreux rôles régulateurs importants dans le développement et la progression des maladies. Compte tenu de l'émergence de thérapies immunitaires efficaces, des prédicteurs fiables de la réponse sont nécessaires. Le profilage des cellules immunitaires détermine la réponse en évaluant les populations de cellules immunitaires provenant d'échantillons traités et non traités. Dans notre cas, nous évaluerons la réponse des globules blancs à l'infection virale en utilisant un procédé appelé "Cytof".

Génomique des leucocytes

Un leucocyte est une cellule incolore qui circule dans le sang et les liquides organiques et qui est impliqué dans la lutte contre les substances étrangères et les maladies. Un génome est l'ensemble du matériel génétique d'un organisme. La génomique est un domaine de la biologie qui se concentre sur la structure, la fonction, l'évolution, la cartographie et l'édition des génomes. Par conséquent, la génomique leucocytaire est l'étude de tout le matériel génétique des leucocytes.

Métabolomique

Métabolomique est une façon d'étudier le métabolisme, c'est-à-dire de mesurer les quantités de métabolites (petites molécules) produites par notre corps lorsque nous transformons les aliments en énergie et autres molécules dont nos cellules ont besoin pour survivre. La technologie métabolomique est "à grande échelle", ce qui signifie que plusieurs milliers de métabolites peuvent être mesurés à partir d'un seul échantillon, par exemple de sang ou d'urine.

Micro ARN

Les cellules utilisent le Micro ARN pour contrôler si un gène particulier produit trop, trop peu ou la quantité normale de sa protéine à un moment donné.