Ce projet vise à tester l'hypothèse de l'azote, à savoir que les sous-produits azotés nocifs du métabolisme énergétique s'accumulent plus facilement dans les cellules des patients atteints d'EM/SFC.
Les mitochondries et leur rôle dans la production d’énergie et la résolution de l’inflammation générée par le stress musculaire et l’exercice physique sont particulièrement intéressants. Il est possible et même probable que des indices de biomarqueurs potentiels pour les malaises post-effort soient révélés dans ces études très détaillées.
HYPOTHÈSE ET DESCRIPTION
Nous émettons l’hypothèse que les sous-produits toxiques contenant de l’azote issus du métabolisme énergétique s’accumulent plus facilement dans les cellules des patients atteints d’EM/SFC. Cette accumulation, à son tour, crée un cycle de production d’énergie pour surmonter un état de stress tout en générant plus de sous-produits azotés toxiques dans le processus. Nous identifierons également les composés qui peuvent contourner la production de sous-produits azotés toxiques et libérer les patients de ce cycle.
CONCEPTION DE L’ÉTUDE
Pour tester cette hypothèse, nous allons mettre en culture des globules blancs dans des milieux de culture additionnés d’acides aminés marqués à l’azote et mesurer les sous-produits marqués à l’azote provenant du métabolisme énergétique. Les cellules de 30 patients atteints d’EM/SFC et de 20 témoins appariés par âge et par sexe seront collectées et traitées au centre de technologie génomique de Stanford et mises en culture pour notre expérience de suivi de l’azote. Ces expériences seront menées sur des cellules sanguines provenant directement de patients atteints d’EM/SFC et sur des cellules cultivées de patients atteints d’EM/SFC.
Pour déterminer s’il y a une accumulation d’ammoniac in vivo, notre meilleure option consiste à observer la concentration de métabolites azotés dans l’urine sur une courte période de temps au cours de laquelle différents niveaux d’activité physique/mentale ont été observés. Les 30 patients atteints d’EM/SFC et les 20 sujets témoins de l’expérience ci-dessus devront fournir tous les échantillons d’urine pendant 4 jours consécutifs (environ 20 échantillons par individu), tandis que les données relatives à leur activité physique et à leur rythme cardiaque seront recueillies à l’aide d’une technologie portable. Normalement, la plupart des sous-produits azotés sont convertis en urée primaire avec les acides aminés, les peptides, la créatine, la créatinine et les polyamines. Dans un état pathologique, les sous-produits azotés toxiques et hautement réactifs sont excrétés dans l’urine sous forme de nitrate, de nitrite et d’ammoniac. Nous mesurerons le rapport entre les métabolites azotés sains et pathologiques dans l’urine et le mettrons en corrélation avec l’activité des métadonnées.
Les microvésicules sont un type de vésicule extracellulaire qui est libérée de la membrane cellulaire. Les vésicules sont de petits sacs ou vacuoles remplis de liquide dans l'organisme. Le séquençage est une technique utilisée pour déterminer la séquence exacte des bases (A, C, G et T) dans une molécule d'ADN (ou virale).
L'étude à grande échelle des protéines, qui sont de grandes molécules complexes nécessaires à la structure, à la fonction et à la régulation des tissus et des organes du corps humain.
Les anticorps qui réagissent avec les molécules de l'organisme et qui sont présents chez les personnes en bonne santé sont appelés anticorps naturels ou auto-anticorps.
L'ADN extracellulaire est souvent sécrété activement et est utilisé pour effectuer plusieurs tâches, offrant ainsi une cible ou un outil attrayant pour les applications biotechnologiques, médicales, environnementales et microbiologiques générales. Les virus sont des parasites intracellulaires qui dépendent dans une large mesure de la cellule hôte pour leur réplication. La réactivation virale se produit lorsqu'une réplication active du génome viral entraîne une infection lytique (dégradation de la cellule) caractérisée par la libération de nouvelles particules virales progénitrices (descendantes).
Le système immunitaire joue de nombreux rôles régulateurs importants dans le développement et la progression des maladies. Compte tenu de l'émergence de thérapies immunitaires efficaces, des prédicteurs fiables de la réponse sont nécessaires. Le profilage des cellules immunitaires détermine la réponse en évaluant les populations de cellules immunitaires provenant d'échantillons traités et non traités. Dans notre cas, nous évaluerons la réponse des globules blancs à l'infection virale en utilisant un procédé appelé "Cytof".
Un leucocyte est une cellule incolore qui circule dans le sang et les liquides organiques et qui est impliqué dans la lutte contre les substances étrangères et les maladies. Un génome est l'ensemble du matériel génétique d'un organisme. La génomique est un domaine de la biologie qui se concentre sur la structure, la fonction, l'évolution, la cartographie et l'édition des génomes. Par conséquent, la génomique leucocytaire est l'étude de tout le matériel génétique des leucocytes.
Métabolomique est une façon d'étudier le métabolisme, c'est-à-dire de mesurer les quantités de métabolites (petites molécules) produites par notre corps lorsque nous transformons les aliments en énergie et autres molécules dont nos cellules ont besoin pour survivre. La technologie métabolomique est "à grande échelle", ce qui signifie que plusieurs milliers de métabolites peuvent être mesurés à partir d'un seul échantillon, par exemple de sang ou d'urine.
Les cellules utilisent le Micro ARN pour contrôler si un gène particulier produit trop, trop peu ou la quantité normale de sa protéine à un moment donné.